بررسی ارتباط بین پلیمورفیسم های rs6499640 و rs17817449 در ژن FTO با بیماری دیابت نوع 2

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 کارشناس ارشد ، گروه ژنتیک، دانشکده ی علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران

2 دانشیار، گروه ژنتیک، دانشکده ی علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران

3 استادیار، گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی دزفول، دزفول، ایران.

10.61186/jsmj.22.5.9

چکیده

مقدمه : دیابت یکی از مشکلات در حال رشد برای سلامتی جوامع سراسر دنیا است و ناشی از تعامل عوامل ژنتیکی و محیطی می باشد. یکی از مهم ترین ژن های مرتبط به دیابت نوع 2 ژن FTO می‌باشد. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم های rs6499640 و rs17817449 در ژن FTO با بیماری دیابت نوع 2 در جمعیت شهرستان دزفول بود.

مواد و روش : در این مطالعه پژوهشی، نمونه ها شامل 100 فرد نرمال و 100 فرد با بیماری دیابت نوع 2 بودند. پس از خونگیری استخراج DNA انجام شد. کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاه از نانودراپ و الکتروفورز سنجیده شد. جهت تعیین ژنوتیپ افراد از تکنیک های ARMS-PCR و Tetra-ARMS-PCRاستفاده شد. سپس با sequencing نتایج ژنوتایپینگ با PCR تایید شد و داده ها مورد آنالیز آماری قرارگرفت.

یافته ها : ارتباط معنی داری در توزیع ژنوتیپ ها بین افراد بیمار و سالم بین پلی مورفیسم های rs6499640 و rs17817449 ژن FTO و افزایش خطر ابتلا به دیابت در جمعیت افراد شهر دزفول مشاهده نشد (به ترتیب P value برابر با 0.728 و 0.085). ولی درمورد پلی مورفیسم rs17817449 بین فراوانی ژنوتیپ GG و ریسک ابتلا به بیماری دیابت نوع دو ارتباط معنی دار مشخص شد.

نتیجه گیری : بر اساس نتایج این پژوهش ارتباطی بین حضور پلی مورفیسم های مورد مطالعه و ابتلا به دیابت نوع 2، در جمعیت بیماران دزفول گزارش نشد. برای تایید این نتایج، مطالعات گسترده تری در جمعیت بزرگتر و نمونه های بیشتر توصیه می گردد.

تازه های تحقیق

Shokoh Vahidnia [PumMed] [Google Scholar]

Elham Siasi [PumMed] [Google Scholar]

Amir Mashaekhi [PumMed] [Google Scholar]

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Alam MR, Chowdhury AI, Alam S. Association of FTO gene (rs9939609) with obesity and type-2 diabetes mellitus: Review from current studies. Rom J Diabetes Nutr Metab Dis. 2021; 28(4): 447–452. [DOI: 10.46389/rjd-2021-1065]
[2] Phani NM, Vohra M, Rajesh S, Adhikari P, Nagri SK, D'Souza SC, Satyamoorthy K, Rai PS. Implications of critical PPARγ2, ADIPOQ and FTO gene polymorphisms in type 2 diabetes and obesity-mediated susceptibility to type 2 diabetes in an Indian population. Mol Genet Genomics. 2016;291(1):193-204. [DOI: 10.1007/s00438-015-1097-4] [PMID]
[3] Baručija-Özçoban I, Ašić A, Bešić L, Halilović S, Marjanovic D, Dogan S. A Decade of the Common FTO rs9939609 Poly-
morphism: A Systematic Review. Coll Antropol. 2018; 42 (2): 147–158. [Link]
[4] Al-Tu’ma FJ, Obed KH. Association between Fat Mass and Obesity Associated (FTO) gene polymorphism (rs9939609) and lipid profile in type 2 diabetic obese Iraqi male. Iraq Med J. 2018; 2(1): 15-19. [Link]
[5] Kar K, Munim MA, Fariha A, Singha Roy A, Rahman MI, Akter S, et al. Association of an intronic SNP rs9939609 in FTO gene with type 2 diabetes mellitus among Bangladeshi population: A case–control study combined with updated meta-analysis. Human Gene. 2023; 35(201133): 1-16. [DOI: 10.1016/j. humgen.2022.201133]
[6] Filimban N, Qusti S, Ghannam N, Shaer N, Y. Sakka M, Al-Mars A, et al. Type 2 diabetes is associated with FTO polymorphism through its effect on increasing the maximum BMI in western region of Saudi Arabia. J Adv Pharm Educ Res. 2017; 7(4): 378-386. [Link]
[7] Bego T, Causevic A, Dujic T, Malenica M, Velija-Asimi Z, Prnjavorac B, et al. Association of FTO gene variant (rs8050136) with type 2 diabetes and markers of obesity, glycaemic control and inflammation. J Med Biochem. 2019; 38: 153 –163. [DOI: 10.2478/jomb-2018-0023] [PMID] [PMCID]
[8] Algenabi AA, Hussein MK, Hadi NR, Nasser FA, Fatima G, Al-Aubaidy HA. Assessing the fat mass and obesity associated gene polymorphisms (rs17817449 and rs1588413) in obesity and type 2 diabetes mellitus. Sys Rev Pharm. 2020;11(6):656-60. [DOI: 10.31838/srp.2020.6.97]
[9] Oğuz O, Gheybi A, Doğan Z, Akbaş F, Zeybek U, Ergen A. Investigation of GHRL (rs4684677), FTO (rs8044769) and PGC1Α (rs8192678) polymorphisms in type 2 diabetic Turkish population. Turk J Biochem. 2022; 47(5): 564–570. [DOI: 10.1515/tjb-2021-0235]
[10] Saucedo R, Valencia J, Gutierrez C, Basurto L, Hernandez M, Puello E, et al. Gene variants in the FTO gene are associated with adiponectin and TNF‑alpha levels in gestational diabetes mellitus. Diabetol Metab Syndr. 2017; 9(32): 1-7. [DOI: 10.1186/s13098-017-0234-0]
[11] Zarza-Rebollo JA, Molina E, Rivera M. The role of the FTO gene in the relationship between depression and obesity. A systematic review. Neurosci Biobehav Rev 2021; 12(7): 630-637. [DOI: 10.1016/j.neubiorev.2021.05.013]
[12] Abdelmajed SS, Youssef M, Zaki ME, Abu-Mandil Hassan N, Ismail S. Association analysis of FTO gene polymorphisms and obesity risk among Egyptian children and adolescents. Gene Dies. 2017; 4: 170e175. [DOI: 10.1016/j.gendis.2017.06.002]
[13] Huong PT, Thu Nguyen CT, Nhung VT. The association between FTO polymorphisms and type 2 diabetes in Asian populations: A meta-analysis. Meta Gene. 2021; 30: 100958. [DOI: 10. 1016/j.mgene.2021.100958]
[14] Czajkowski P, Adamska-Patruno E, Bauer W, Fiedorczuk J, Krasowska U, Moroz M, et al. The Impact of FTO Genetic Variants on Obesity and Its Metabolic Consequences is Dependent on Daily Macronutrient Intake. Nutrients. 2020; 12(3255): 1-26. [DOI: 10.3390/nu12113255]
[15] Czajkowski P, Adamska-Patruno E, Bauer W, Krasowska U, Fiedorczuk J, Moroz M, et al. Dietary Fiber Intake May Influence the Impact of FTO Genetic Variants on Obesity Parameters and Lipid Profile—A Cohort Study of a Caucasian Population of Polish Origin. Antioxid 2021; 10(1793): 1-17. [DOI: 10.3390/antiox10111793] [PMID] [PMCID]
[16] Kamura Y, Iwata M, Maeda S, Shinmura S, Koshimizu Y, Honoki H, Fukuda K, Ishiki M, Usui I, Fukushima Y, Takano A, Kato H, Murakami S, Higuchi K, Kobashi C, Tobe K. FTO Gene Polymorphism Is Associated with Type 2 Diabetes through Its Effect on Increasing the Maximum BMI in Japanese Men. PLoS One. 2016;11(11):e0165523. [DOI: 10.1371/journal.pone. 0165523] [PMID] [PMCID]
[17] Yang Y, Liu B, Xia W, Yan J, Liu HY, Hu L, Liu SM. FTO Genotype and Type 2 Diabetes Mellitus: Spatial Analysis and Meta-Analysis of 62 Case-Control Studies from Different Regions. Genes. 2017; 8(70): 1-16. [DOI: 10.3390/genes8020070] [PMID] [PMCID]
[18] Liu AL, Xie HJ, Xie HY, Liu J, Yin J, Hu JS, Peng CY. Association between fat mass and obesity associated (FTO) gene rs9939609 A/T polymorphism and polycystic ovary syndrome: a systematic review and meta-analysis. BMC Med Gene. 2017; 18(89): 1-7. [DOI : 10.1186/s12881-017-0452-1]
[19] Lan N, Lu Y, Zhang Y, Pu S, Xi H, Nie X, Liu J, Yuan W. FTO –A Common Genetic Basis for Obesity and Cancer. Front. Genet 2020; 11:559138. [DOI: 10.3389/fgene.2020.559138]
[20] Mielcarska S, Stopińska K, Poręba M, Szywacz W, Macionga A, Szweda-Gandor N, et al. Influence of the FTO polymorphism rs17817449 on the risk of obesity, type 2 diabetes, and cardiovascular diseases in Upper Silesian population a preliminary, cross-sectional study. Med Res J 2022; 7 (2): 134–141. [DOI: 10.5603/MRJ.a2022.0019]
[21] Gao L, Wu L, Zhang M, Zhao X, Cheng H, Mi J. Gender-specific association of the rs6499640 polymorphism in the FTO gene with plasma lipid levels in Chinese children. Gene Molecul Bio. 2018; 41(2): 397-402. [DOI: 10.1590/1678-4685-GMB-2017-0107] [PMID] [PMCID]
[22] Huong PT, Nguyen CTT, Nhung VT. The association between FTO polymorphisms and type 2 diabetes in Asian populations: A meta-analysis. Meta Gene. 2021; 30 (100958): 1-9. [DOI: 10.1016/j.mgene.2021.100958]
[23] Younus LA, A. Algenabi AH, S. Abdul-Zhara M, K. Hussein M. FTO gene polymorphisms (rs9939609 and rs17817449) as predictors of Type 2 Diabetes Mellitus in obese Iraqi population. Gene. 2017; 627: 79-84. [DOI: 10.1016/j.gene. 2017.06.005] [PMID]
[24] Sabry HJ, Ibrahim ME, El Fadeel SA, El-Fallah AA. Study of FTO Gene Polymorphism Association with Type 2 Diabetes and Increasing BMI in Egyptian Patients. BJAS. 2020; 5(5): 67-74. [DOI: 10.21608/bjas.2020.136647]
606
Vahidnia Sh, et al. rs6499640 and rs17817449 polymorphisms and diabetes type 2. JSMJ. 2023; 22(5):594-606
Jundishapur
Journal of Medical Sciences
November & December 2024. Vol 22. No 5
[25] Khoshi A, Bajestani MK, Shakeri H, Goodarzi G, Azizi F. Association of Omentin rs2274907 and FTO rs9939609 gene polymorphisms with insulin resistance in Iranian individuals with newly diagnosed type 2 diabetes. Lipids Health Dise. 2019; 18(142): 1-10. [DOI: 10.1186/s12944-019-1085-5] [PMID] [PMCID]
[26] Sabarneh A, Ereqat S, Cauchi S, AbuShamma O, Mohammad Abdelhafez M, Murad Ibrahim M, et al. Common FTO rs9939609 variant and risk of type 2 diabetes in Palestine. BMC Med Gene. 2018; 19(1): 156. [DOI: 10.1186/s12881-018-0668-8] [PMID] [PMCID]
[27] Khan S, Verma AK, Khan V, Bhatt D, Rafat S, A. Alsahli M, et al. Role of FTO and MC4R Polymorphisms in Escalating Obesity and Their Indirect Association with Risk of T2D in Indian Population. Diabetes Ther. 2020; 11: 2145–2157. [DOI: 10.1007/s13300-020-00896-w] [PMID] [PMCID]
[28] Naaz K, Kumar A, Choudhury I. Assessment of FTO Gene Polymorphism and its Association with Type 2 Diabetes Mellitus in North Indian Populations. Ind J Clin Beachem. 2019; 34(4): 479–484. [DOI: 10.1007/s12291-018-0778-2] [PMID] [PMCID]
[29] Shaikh F, Tazeen shah T, Bazekh Madkhali NA, Gaber A, F. Alsanie W, et al. Frequency distribution and association of Fat-mass and obesity (FTO) gene SNP rs-9939609 variant with Diabetes Mellitus Type-II population of Hyderabad, Sindh, Pakistan. Saudi J Bio Sci.2021; 28: 4183–4190. [DOI: 10.1016/j.sjbs.2021.06.001] [PMID] [PMCID]